龟头上起红色小疙瘩，可能是以下因素所导致：1.阴茎珍珠状丘疹，属于一种良性的病变，一般不会引起其他临床症状，也不会危害到男性的生殖系统健康，可不予进行治疗。在必要时，可通过激光或冷冻等疗法予以祛除。2.如果男性存在包皮过长，长时间不对包皮内部进行清洗，有可能会引起包皮龟头炎，也会导致龟头上红色小疙瘩，一般还伴有发痒、疼痛等症状。3.如果男性存在不洁的性生活，有可能被传染上尖锐湿疣，就会使龟头上出现红色小疙瘩，还容易出现溃破、渗出等症状。