卵巢囊肿如果是病理情况下吃药不能消除。因为卵巢囊肿在临床上首选的治疗方法就是手术进行治疗，吃药只是在某种程度上可能会抑制卵巢囊肿的生长速度，但是并不能达到消除囊肿的目的。所以建议及时做术前检查，比如白带常规化验检查、宫颈癌筛查以及肿瘤标志物检查、肝功能、肾功能检查等，然后做手术的准备。如果是巧克力囊肿在术后一定要预防复发，可以考虑在宫内上曼月乐环。如果是其他的囊肿，在术后也要定期去医院复查。对于卵巢巧克力囊肿，如果计划怀孕的情况下，在手术之后尽快考虑怀孕，以免复发以后对怀孕会造成影响。