日本鸢尾有微毒。可以治咽喉肿痛、治肝炎，胃痛、还可治牙龈肿痛。根和叶毒性较强。日本鸢尾观赏性价值很强的植物。是有一定的药用功能，虽然它的功效很强，但是需要对症用药，不建议自行选择药物进行运用，以免用药不当，引起不良反应。一定要在医生的指导下进行使用。合理对症进行运用的情况下，治疗效果还是非常不错的。