首先建议使用抗生素治疗2周，对于肾结石许也感染患者使用高效的抗生素疗程可缩短至7天。对于清症状病例可采用口服喹诺酮类的药物进行治疗。同时，如果致病菌是革兰阳性菌，可以单用阿莫西林或者阿莫西林克拉维酸钾治疗。对于重症病例或不能口服药物者，应该住院治疗。静脉使用喹诺酮类的药物或光谱的头孢类抗菌素，来进行治疗，同时，也可以选择安曲南治疗。如果致病菌是革兰阳性球菌，可以选择舒巴坦钠，必要时服用药物进行治疗。同时，应该定期进行化验，详细的检查。