早晨起床的时候脑子不清醒，主要和以下因素有关：1.早晨刚起床的时候，大部分的脑细胞处于清醒的状态。但是，还有部分的脑细胞未适应起床的状态，这时患者会表现为脑子不清醒。一般持续数分钟以后，症状会逐渐地消失。2.早晨起床脑子不清醒，还可能和脑供血不足有一定关系。如果患者既往有慢性脑供血不足的病史，晨起后大脑会出现缺血、缺氧，而出现自觉脑子不清醒的感觉。早晨脑子不清醒可能和其他的疾病有关，例如严重的贫血、血糖升高和降低、血压增高，都有可能出现早晨脑袋不清醒的症状。