小便后腰痛，需要到医院检查，先明确原因以后再对症用药处理。1.如果检查存在肾盂肾炎，则需要进行尿培养，根据培养的结果，针对性用药。绝大多数都是大肠埃希氏菌引起，可以口服头孢类或者喹诺酮类的抗菌素进行治疗，比如头孢克肟胶囊、盐酸左氧氟沙星胶囊等药物进行治疗。具体要遵照医嘱，按足量的疗程服用。2.可能有肾结石或者输尿管上段结石。如果检查确诊以后，根据结石的大小，选择体外冲击波碎石或者口服排湿药，比如口服排石颗粒等药物。对于比较大的结石或者合并严重肾积水。必要时需要进行手术治疗，具体要根据结石的位置大小、肾积水的程度来进一步判断。