小檗碱服用后对肝肾也会有影响，只不过相对这种药物对肝肾的影响比较小。任何药物服用后，也都需要经过肝肾的分解代谢，小檗碱也不例外。如果长期或过量服用，也是有可能会损害到肝肾功能，所以小檗碱药物的使用，要按照药物使用说明或遵医嘱用药。小檗碱为肠道的抗感染药，临床上主要用于肠胃炎的治疗，比如痢疾杆菌或者大肠杆菌所引起的肠道感染类疾病。这种药物口服后的不良反应相对较少，偶尔有患者用药后，可出现反胃、恶心，或者发生呕吐，但通常停药后可消失。