冠状沟小疙瘩要根据病因选择合适的方法，具体如下：1.尖锐湿疣形成的小疙瘩，呈现出菜花状、鸡冠状突起，可给予液态冷冻、激光电灼、手术等方式去除，结合抗病毒药物治疗。2.炎症刺激引起的小疙瘩，局部可以涂抹消炎药膏，比如莫匹罗星软膏、红霉素软膏等控制炎症，炎症消退后疙瘩会消失。3.生殖器疱疹形成的小疙瘩，需要给予抗病毒药物治疗，比如阿昔洛韦、伐昔洛韦、泛昔洛韦等药物，结合应用中药调理。同时，积极锻炼身体以提高免疫功能。