小便刺痛龟头流黄脓，可能是化脓性龟头炎、性病感染、龟头癌等原因导致的。1.化脓性龟头炎。正常情况下，包皮内寄生着大量的细菌、酵母菌，在全身抵抗力下降的时候，这些微生物会成为致病体，对龟头黏膜造成损害，从而导致化脓、小便刺痛。2.性病感染。一般高危性行为会导致衣原体、支原体、螺旋体传播的概率增加，这些病菌会影响男性生殖部位，导致男性尿道口有脓液排出，小便时感染部位受到刺激，疼痛明显。3.龟头癌。发生龟头癌后龟头表面会出现菜花样的肿胀物，肿胀物表面破损后，便会出现流脓、小便刺痛感。