嘴唇上起小疙瘩的原因有以下几点：1.因为嘴唇上因病毒感染而生长的小疱疹，一般呈现出透明状，还会伴有疼痛的症状，应该对局部涂抹抗病毒的药物，常用的是阿昔洛韦乳膏，病毒感染严重的需要进行全身的抗病毒治疗。2.进食了容易引起过敏的食物，比如海鲜、芒果等，出现过敏反应后会伴有小疙瘩以及瘙痒的症状，需要及时进行抗过敏治疗。3.如果是小孩，因为不注意卫生或者经常吃手，导致局部细菌感染而引起的。