复方鱼腥草合剂有清热解毒作用，所以对于风热感冒引起的咳嗽、咽喉肿痛有一定的治疗作用。在临床中还可以治疗肺痈，特别是咳嗽有浓痰，或者是金黄色葡萄球菌引起的肺炎，可以作为辅助用药。但是一些风寒感冒引起的咳嗽，特别是怕风怕冷，然后舌苔白，这样的咳嗽就不要用复方鱼腥草合剂。如果是咳嗽发热，然后呼吸困难的症状，最好检查胸片，就不要用复方鱼腥草合剂了，可能需要输液治疗。